Contribution à l'étude du réseau de régulation génique de la différenciation cardiaque chez la drosophile : approches génomiques

Un grand nombre de maladies cardiaques apparaissent à la suite de problèmes développementaux dus à des mutations dans des gènes très conservés durant l'évolution. Il est donc crucial d'identifier les acteurs intervenants dans la cardiogenèse. Durant ma thèse, j'ai étudié la différenciation cardiaque, en utilisant la Drosophile comme modèle, avec comme objectifs d'identifier des nouveaux intervenants grâce à l'acquisition de données globales par une approche génomique tissue spécifique. J'ai tout d'abord mis au point un protocole permettant d'acquérir des données génomique spécifiquement dans le tube cardiaque de la Drosophile lors de la différenciation des cardiomyocytes. Ce fut une étape primordiale pour le reste de ma thèse. Ce protocole me permet d'isoler spécifiquement les cellules du système cardiaque.A partir de là, j'ai réalisé une cinétique transcriptomique qui a permis de mettre en évidence environ 1000 gènes différenciellement exprimés au cours de la différenciation cardiaque. Ensuite, En collaboration avec Delphine Potier, une thésarde bio-informaticienne de l'équipe, des modules Cis-régulateur (CRM) pouvant conduire à l'expression dans le tube cardiaque ont été prédits, ainsi que des facteurs de transcription putatifs régulant ces CRM. Ces nouveaux acteurs du réseau de régulation génique cardiaque sont en cours de validation.Dans un second temps, je me suis intéressé à un facteur de transcription à homéoboîte clé de la cardiogenèse : Abdominal-A (AbdA). AbdA est essentiel pour la différenciation de la partie postérieure du tube cardiaque, le cœur proprement dit, et à l'acquisition de sa fonction. Cependant, ses cibles ainsi que son action tissue spécifique sont encore inconnu à ce jourAfin d'apporter un élément de réponse, j'ai analysé le transcriptome consécutif à un Gain de Fonction de AbdA spécifiquement dans le système cardiaque ce qui m'a permis de mettre en évidence plus de 1000 gènes dérégulés par AbdA lors de la différenciation cardiaque.