Sensibilité et permissivité des larves de poisson-zèbre (Danio rerio) aux cyprinivirus

L'Anguillid herpèsvirus 1 (AngHV-1), le Cyprinid Herpèsvirus (CyHV-2) et le Cyprinid Herpèsvirus 3 (CyHV-3) sont trois cyprinivirus d'importance économique qui provoquent des maladies uniquement chez leurs hôtes naturels. Cependant, les cellules provenant d'hôtes non naturels peuvent être infectées, même de manière inefficace, par des cyprinivirus. Récemment, il a été démontré que le CyHV-3 se répliquait dans des lignées cellulaires de poisson-zèbre (Danio rerio) et qu'il induisait une infection avortée après inoculation intrapéritonéale chez le poisson-zèbre adulte. Le poisson-zèbre est un organisme modèle de plus en plus utilisé en virologie. Contrairement aux hôtes naturels des cyprinivirus, ce cyprinidé peut être facilement et rapidement manipulé génétiquement, ce qui facilite les recherches sur la fonction des gènes ou leur contribution à divers processus biologiques. La présente thèse a contribué (i) à évaluer et à comparer l'AngHV-1, le CyHV-2 et le CyHV-3 en termes de capacité à infecter des modèles de poisson-zèbre à la fois in vitro et in vivo et (ii) à mieux comprendre la réponse antivirale à l'infection par les cyprinivirus chez les larves de poisson-zèbre. Les résultats ont révélé que des infections pouvaient être établies en utilisant des modèles d'infection artificiels in vitro (lignées cellulaires de poisson-zèbre) et in vivo (micro-injection de larves). Cependant, les infections étaient transitoires, avec une clairance virale rapide associée à une mort des cellules infectées morphologiquement compatible avec l'apoptose. L'analyse transcriptomique des larves infectées par le CyHV-3 a révélé une régulation positive des gènes stimulés par l'interféron, en particulier ceux qui codent pour les médiateurs de la mort cellulaire programmée. Il est à noter que des gènes d'ARN non codants non caractérisés et des rétrotransposons figuraient également parmi les gènes les plus régulés positivement. L'inactivation par CRISPR/Cas9 du gène du poisson-zèbre codant pour la protéine kinase R (PKR) et d'un gène apparenté codant pour une protéine kinase contenant des domaines de liaison à l'ADN Z (PKZ) n'a pas eu d'impact sur la clairance du CyHV-3 chez les larves. En conclusion, ce projet soutient fortement l'importance des interactions entre l'immunité innée et les virus dans l'adaptation des cyprinivirus à leurs hôtes naturels et souligne le potentiel du modèle CyHV-3-poisson-zèbre, par rapport au modèle CyHV-3-carpe, pour l'étude de ces interactions.