Bioprospeksi Laut Dalam Indonesia Berbasis Genom

Indonesia adalah negara maritim dengan luas perairan yang lebih besar dibandingkan luas daratannya. Pengaruh kondisi lingkungan laut yang lebih bervariasi dibanding dengan lingkungan darat menjadikannya sebagai sumber penting untuk natural products dengan karakteristik biokimia yang unik dan memiliki prospek untuk dikembangkan di bio industri. Namun, sebagian besar keanekaragaman hayati laut, terutama laut dalam Indonesia, masih belum tergali. Oleh karena itu, bioprospeksi laut dalam Indonesia baik dari organisme yang dapat maupun tidak dapat ditumbuhkan dengan pendekatan berbasis genom melalui akselerasi penelitian dari hulu ke hilir untuk dapat menghasilkan natural products sangat penting dilakukan. Kegiatan penelitian yang kami lakukan difokuskan untuk eksplorasi potensi biodiversitas laut dalam Indonesia, terutama melalui data genom mikroba yang berpotensi menghasilkan natural products. Saat ini, kami telah menghasilkan data Whole Genome Sequence pertama dari bakteri laut dalam Indonesia, yaitu Priestia flexa yang berhasil diisolasi dari sampel air laut dalam (1.000 m) di wilayah perairan Java Trench. Hasil penelitian ini menjadi dasar untuk menemukan potensi pengembangan dua natural products dengan nilai ekonomis tinggi, yaitu lycopene dan lasso peptide (paeninodin). Kegiatan penelitian ini merupakan kerjasama terintegrasi berupa penelitian multidisiplin yang terkait studi biodiversitas dan lingkungan laut dalam Indonesia, bioinformatika dan big data genom, bioprospeksi natural products berbasis genom, biosintesis, serta optimasi biosintesis senyawa dari mikroorganisme laut dalam serta bioutilisasi natural products. Secara keseluruhan, penelitian yang kami lakukan diharapkan akan mendukung kemandirian Indonesia dalam menghasilkan natural products dengan nilai ekonomis yang tinggi.