Culture du genre bactérien Treponema associé au microbiote humain

Les tréponèmes sont des bactéries fastidieuses comprenant des espèces commensales, du microbiote humain et des pathogènes notoires tels que T. pallidum, agent de la syphilis chez l’homme, et T. denticola membre de complexe rouge fortement associée à la maladie parodontale. Depuis le début du 20e siècle, de nombreuses études se sont attelées infructueusement à la culture axénique de cette espèce. Ces essais ont permis la mise en place de milieux adaptés à la croissance des tréponèmes et à l’isolement d’autres membres du genre Treponema. La première partie de ce doctorat s’est attelée à la formulation d’un milieu unique pour les tréponèmes « Raoult-T », de manière à disposer d’un milieu standard pour l’isolement de la plupart des tréponèmes. Ce travail a également porté sur la mise en place d’une technique d’isolement efficace, permettant non seulement l’isolement primaire des tréponèmes à partir d’un échantillon complexe, mais également l’élimination des microorganismes contaminants. Ce travail a permis d’élargir le répertoire des tréponèmes isolés de la cavité buccale humaine de dix à treize. De plus, par le screening de nombreux agents antimicrobiens, l’effet bénéfique, de deux molécules antimitotiques, la vinblastine et la vincristine, sur la croissance des tréponèmes testés a été mis en évidence. En comparant in-silico des métagénomes prévalents en tréponèmes à d’autres dépourvus de tréponèmes, nous avons identifié de potentiels antagonistes, fortement fréquents en l’absence de tréponèmes comprenant essentiellement des membres de la famille des Bifidobacteriaceae. L’activité antagoniste a été confirmés in vitro par des tests d'inhibition contre Treponema denticola.