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Bacilles à Gram négatif résistants aux carbapénèmes dans les hôpitaux de niveau tertiaire de Niamey, Niger

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Introduction : Les carbapénèmes sont des antibiotiques à large spectre utilisés en dernier recours pour le traitement des infections dues aux bactéries multirésistantes. L’objectif de cette étude était de déterminer la prévalence et les facteurs associés à la résistance des bacilles à Gram négatif aux carbapénèmes dans les laboratoires des trois hôpitaux tertiaires de Niamey. Méthodologie : Il s’agissait d’une étude transversale allant du décembre 2022 à juillet 2023. Tous les bacilles à Gram négatif (BGN) isolés dans les laboratoires des trois hôpitaux tertiaires de Niamey ont été inclus dans ce travail. Les antibiogrammes ont été réalisés et interprétés suivant les recommandations de EUCAST 2023. Une analyse logistique univariée et multivariée a été réalisée pour déterminer les facteurs de risque associés à la résistance des BGN aux carbapénèmes. Une valeur p inférieure à 0,05 était considérée comme significative. Résultats : Au total 502 souches de BGN ont été isolées de différents échantillons cliniques. Ces souches provenaient majoritairement des patients de sexe masculin (62,7%, sex-ratio =1,69). L’âge médian des patients était de 38 ans (Intervalle interquartile : 7 - 62 ans). Les échantillons à partir desquels les BGN avaient été isolés étaient majoritairement constitués des prélèvements urinaires (67,7%). Les entérobactéries représentaient 92,8% (n=466) des BGN isolés. La fréquence de la résistance des BGN aux carbapénèmes était de 5,8% (n= 29). A l’analyse logistique multivariée, les facteurs de risque significativement associés à la résistance des BGN aux carbapénèmes étaient constitués des prélèvements non urinaires (Odds Ratio ajusté = 24,9; IC95% = 5,92 – 122,67 ; p value < 0,001) et la résistance aux nitrofuranes (Odds Ratio ajusté = 11,99 ; IC 95% : 1,80 – 83,46 ; p value < 0,010). Conclusion : Il ressort de cette étude que la résistance des BGN aux carbapénèmes est élevée au Niger. Des études ultérieures sur les gènes de résistance aux carbapénèmes circulants au Niger seront nécessaires afin de renforcer la connaissance sur l’antibiorésistance, problème majeur de santé publique. AbstractBackground: Carbapenems are broad-spectrum antibiotics used as a last resort for the treatment of infections caused by multidrug-resistant bacteria. This study aimed to determine the prevalence and factors associated with carbapenem resistance in Gram-negative bacilli. Methods: This was a cross-sectional study conducted from December 2022 to July 2023. All Gram-negative bacilli (GNB) isolated in the laboratories of the three tertiary hospitals in Niamey were included in this study. Antibiotic susceptibility testing (AST) was performed and interpreted according to EUCAST 2023 recommendations. Univariate and multivariate logistic analyses were performed to determine risk factors associated with carbapenem resistance in GNB. A p-value less than 0.05 was considered significant. Results: A total of 502 GNB strains were isolated from different clinical samples. These strains were predominantly from male patients (62,7%, sex ratio = 1.69). The median age of patients was 38 years (interquartile range: 7 - 62 years). The samples from which GNB were isolated were predominantly urine samples (67.7%). Enterobacteriaceae represented 92.8% (n=466) of the isolated BGN. The frequency of GNB resistance to carbapenems was 5.8% (n = 29). In multivariate logistic analysis, risk factors significantly associated with resistance of BGN to carbapenems were non-urinary samples (adjusted odds ratio = 24.9; 95% CI = 5.92 – 122.67; p value < 0.001) and resistance to nitrofurans (adjusted odds ratio = 11.99; 95% CI: 1.80 – 83.46; p value < 0.010). Conclusion: This study shows that carbapenem resistance among GNBs was relatively high in Niger. Further studies on circulating carbapenem resistance genes in Niger will be necessary to complete this study.
Title: Bacilles à Gram négatif résistants aux carbapénèmes dans les hôpitaux de niveau tertiaire de Niamey, Niger
Description:
Introduction : Les carbapénèmes sont des antibiotiques à large spectre utilisés en dernier recours pour le traitement des infections dues aux bactéries multirésistantes.
L’objectif de cette étude était de déterminer la prévalence et les facteurs associés à la résistance des bacilles à Gram négatif aux carbapénèmes dans les laboratoires des trois hôpitaux tertiaires de Niamey.
Méthodologie : Il s’agissait d’une étude transversale allant du décembre 2022 à juillet 2023.
Tous les bacilles à Gram négatif (BGN) isolés dans les laboratoires des trois hôpitaux tertiaires de Niamey ont été inclus dans ce travail.
Les antibiogrammes ont été réalisés et interprétés suivant les recommandations de EUCAST 2023.
Une analyse logistique univariée et multivariée a été réalisée pour déterminer les facteurs de risque associés à la résistance des BGN aux carbapénèmes.
Une valeur p inférieure à 0,05 était considérée comme significative.
Résultats : Au total 502 souches de BGN ont été isolées de différents échantillons cliniques.
Ces souches provenaient majoritairement des patients de sexe masculin (62,7%, sex-ratio =1,69).
L’âge médian des patients était de 38 ans (Intervalle interquartile : 7 - 62 ans).
Les échantillons à partir desquels les BGN avaient été isolés étaient majoritairement constitués des prélèvements urinaires (67,7%).
Les entérobactéries représentaient 92,8% (n=466) des BGN isolés.
La fréquence de la résistance des BGN aux carbapénèmes était de 5,8% (n= 29).
A l’analyse logistique multivariée, les facteurs de risque significativement associés à la résistance des BGN aux carbapénèmes étaient constitués des prélèvements non urinaires (Odds Ratio ajusté = 24,9; IC95% = 5,92 – 122,67 ; p value < 0,001) et la résistance aux nitrofuranes (Odds Ratio ajusté = 11,99 ; IC 95% : 1,80 – 83,46 ; p value < 0,010).
Conclusion : Il ressort de cette étude que la résistance des BGN aux carbapénèmes est élevée au Niger.
Des études ultérieures sur les gènes de résistance aux carbapénèmes circulants au Niger seront nécessaires afin de renforcer la connaissance sur l’antibiorésistance, problème majeur de santé publique.
 AbstractBackground: Carbapenems are broad-spectrum antibiotics used as a last resort for the treatment of infections caused by multidrug-resistant bacteria.
This study aimed to determine the prevalence and factors associated with carbapenem resistance in Gram-negative bacilli.
Methods: This was a cross-sectional study conducted from December 2022 to July 2023.
All Gram-negative bacilli (GNB) isolated in the laboratories of the three tertiary hospitals in Niamey were included in this study.
Antibiotic susceptibility testing (AST) was performed and interpreted according to EUCAST 2023 recommendations.
Univariate and multivariate logistic analyses were performed to determine risk factors associated with carbapenem resistance in GNB.
A p-value less than 0.
05 was considered significant.
Results: A total of 502 GNB strains were isolated from different clinical samples.
These strains were predominantly from male patients (62,7%, sex ratio = 1.
69).
The median age of patients was 38 years (interquartile range: 7 - 62 years).
The samples from which GNB were isolated were predominantly urine samples (67.
7%).
Enterobacteriaceae represented 92.
8% (n=466) of the isolated BGN.
The frequency of GNB resistance to carbapenems was 5.
8% (n = 29).
In multivariate logistic analysis, risk factors significantly associated with resistance of BGN to carbapenems were non-urinary samples (adjusted odds ratio = 24.
9; 95% CI = 5.
92 – 122.
67; p value < 0.
001) and resistance to nitrofurans (adjusted odds ratio = 11.
99; 95% CI: 1.
80 – 83.
46; p value < 0.
010).
Conclusion: This study shows that carbapenem resistance among GNBs was relatively high in Niger.
Further studies on circulating carbapenem resistance genes in Niger will be necessary to complete this study.

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