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L’appel de l’ISO
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Depuis plusieurs décennies, les Science & Technology Studies (STS) ont mis en évidence le rôle central des normes et standards dans la construction et la circulation du savoir technoscientifique et biomédical. Cependant, deux angles morts persistent : d’une part, la standardisation des pratiques bio-informatiques, essentielles en biomédecine contemporaine, reste sous-explorée ; d’autre part, les préparations aux épreuves de standardisation (tests, évaluations, audits) sont rarement étudiées. Cet article comble partiellement ces lacunes en documentant la préparation à une épreuve de standardisation d’un pipeline bio-informatique au sein d’un centre suisse spécialisé en génomique computationnelle. À partir d’une enquête ethnographique de quatre mois, il analyse la manière dont une équipe de bio-informaticien·nes compare deux suites logicielles – GATK et DRAGEN – pour l’appel de variants, dans le cadre d’une démarche de conformité au standard ISO 15189 qui spécifie les exigences de qualité pour les laboratoires biomédicaux. L’étude met en lumière les stratégies mises en œuvre pour identifier, qualifier et négocier les écarts entre ces outils logiciels, en soulignant la marge d’interprétation propre aux processus de standardisation en bio-informatique. Elle propose également une réflexion plus large sur l’articulation entre standardisation et préparation en bio-informatique, suggérant que ces épreuves ne se limitent pas à des procédures techniques, mais impliquent également un travail créatif d’optimisation et d’anticipation. En révélant les dynamiques de pouvoir, de négociation et d’adaptation qui nourrissent les pratiques de standardisation en bio-informatique, cette analyse contribue à une meilleure compréhension du rôle des standards dans l’évolution des infrastructures biomédicales qui soutiennent la mise en place d’une médecine dite personnalisée ou de précision.
Title: L’appel de l’ISO
Description:
Depuis plusieurs décennies, les Science & Technology Studies (STS) ont mis en évidence le rôle central des normes et standards dans la construction et la circulation du savoir technoscientifique et biomédical.
Cependant, deux angles morts persistent : d’une part, la standardisation des pratiques bio-informatiques, essentielles en biomédecine contemporaine, reste sous-explorée ; d’autre part, les préparations aux épreuves de standardisation (tests, évaluations, audits) sont rarement étudiées.
Cet article comble partiellement ces lacunes en documentant la préparation à une épreuve de standardisation d’un pipeline bio-informatique au sein d’un centre suisse spécialisé en génomique computationnelle.
À partir d’une enquête ethnographique de quatre mois, il analyse la manière dont une équipe de bio-informaticien·nes compare deux suites logicielles – GATK et DRAGEN – pour l’appel de variants, dans le cadre d’une démarche de conformité au standard ISO 15189 qui spécifie les exigences de qualité pour les laboratoires biomédicaux.
L’étude met en lumière les stratégies mises en œuvre pour identifier, qualifier et négocier les écarts entre ces outils logiciels, en soulignant la marge d’interprétation propre aux processus de standardisation en bio-informatique.
Elle propose également une réflexion plus large sur l’articulation entre standardisation et préparation en bio-informatique, suggérant que ces épreuves ne se limitent pas à des procédures techniques, mais impliquent également un travail créatif d’optimisation et d’anticipation.
En révélant les dynamiques de pouvoir, de négociation et d’adaptation qui nourrissent les pratiques de standardisation en bio-informatique, cette analyse contribue à une meilleure compréhension du rôle des standards dans l’évolution des infrastructures biomédicales qui soutiennent la mise en place d’une médecine dite personnalisée ou de précision.
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