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Identificação e diversidade genética de rotylenchulus reniformis em áreas de cultivos de meloeiro (cucumis melo l.)

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Este trabalho objetivou identificar através de análises microscópicas e moleculares a presença do nematoide Rotylenchulus reniformis em diferentes áreas produtoras de melão e verificar a diversidade genética. Foram coletadas 30 amostras de solos em diferentes áreas de cada fazenda, são elas: cinco do estado do Rio Grande do Norte (Dinamarca, Brazil Melon, CY Matsumoto, Itaueira e Agrícola Famosa) e uma do Ceará (Mata Fresca). Onde, as amostras foram levadas para casa de vegetação e semeadas com a cultivar de melão Vedrantais. Após 35 dias da semeadura, as plantas foram coletadas e suas raízes submetidas ao processo de coloração para identificação microscópica de R. reniformis. O DNA das raízes do meloeiro foi extraído visando as análises moleculares com os primers universais para nematoides e genes específicos para R. reniformis. Para o estudo da diversidade genética, R. reniformis foi isolado de suspensões de amostras do solo em microscópio óptico. Em seguida o DNA dos mesmos foi extraído através do kit de extração NucleoSpin Tissue (Macherey-Nagel)®. As análises do DNA foram realizadas a partir da triagem de 20 iniciadores RAPD. Os dados gerados foram analisados pelo programa Genes. Das 22 amostras de raízes avaliadas microscopicamente, apenas três revelaram a presença de fêmeas de R. reniformis. No que tange as análises moleculares com o primer universal, 15 áreas pertencentes a cinco fazendas foram positivas para a presença do DNA de nematoides. Já as análises com primers genes específicos revelaram que seis áreas, restritas a duas fazendas (Itaueira e Mata Fresca), foram confirmadas com a presença de R. reniformis. Apenas nove dos 20 iniciadores RAPD foram selecionados para a análise de diversidade, os quais geraram 67 bandas polimórficas (95,71 %) e três monomórficas (4,29%), evidenciando assim um alto polimorfismo, perfazendo uma média de 7,4 bandas polimórficas por iniciador. O iniciador com maior número de bandas polimórficas foi o OPAA-04 com 11 bandas enquanto o OPA-03 foi o iniciador que apresentou o menor número (5). Um dendrograma foi construído pelo método hierárquico UPGMA. Utilizando um ponto de corte de 0,55, verificou-se dois grupos. O primeiro formado pelas fazendas Iraueira e Mata Fresca e o segundo grupo pelas demais fazendas. As estimativas de correlação cofenética, estresse e distorção indicaram que o agrupamento foi eficiente e com pequena perda de informação. Já para o dendrograma obtido a partir de 51 amostras de R. reniformis, observou-se a formação de seis grupos. O maior grupo formado foi o V, contemplando 34 amostras, aproximadamente 66,7%. A correlação cofenética foi estimada em 0,77%. Verificou-se que o estudo não indicou nenhuma associação entre as magnitudes das dissimilaridades e a origem das amostras. Verificou-se que o maior (0,92) e o menor (0,27) valor de similaridade encontrado foi entre amostras pertencentes à Fazenda Itaueira. O estudo indica que há variabilidade entre as amostras com um coeficiente médio de dissimilaridade de 0,63 e um coeficiente de variação 14,88%. Este é o primeiro estudo da variabilidade genética com marcadores moleculares realizado com amostras oriundas de campos de produção da principal região exportadora de melão no Brasil.
Editora da Universidade Federal Rural do Semi-Arido - EdUFERSA
Title: Identificação e diversidade genética de rotylenchulus reniformis em áreas de cultivos de meloeiro (cucumis melo l.)
Description:
Este trabalho objetivou identificar através de análises microscópicas e moleculares a presença do nematoide Rotylenchulus reniformis em diferentes áreas produtoras de melão e verificar a diversidade genética.
Foram coletadas 30 amostras de solos em diferentes áreas de cada fazenda, são elas: cinco do estado do Rio Grande do Norte (Dinamarca, Brazil Melon, CY Matsumoto, Itaueira e Agrícola Famosa) e uma do Ceará (Mata Fresca).
Onde, as amostras foram levadas para casa de vegetação e semeadas com a cultivar de melão Vedrantais.
Após 35 dias da semeadura, as plantas foram coletadas e suas raízes submetidas ao processo de coloração para identificação microscópica de R.
reniformis.
O DNA das raízes do meloeiro foi extraído visando as análises moleculares com os primers universais para nematoides e genes específicos para R.
reniformis.
Para o estudo da diversidade genética, R.
reniformis foi isolado de suspensões de amostras do solo em microscópio óptico.
Em seguida o DNA dos mesmos foi extraído através do kit de extração NucleoSpin Tissue (Macherey-Nagel)®.
As análises do DNA foram realizadas a partir da triagem de 20 iniciadores RAPD.
Os dados gerados foram analisados pelo programa Genes.
Das 22 amostras de raízes avaliadas microscopicamente, apenas três revelaram a presença de fêmeas de R.
reniformis.
No que tange as análises moleculares com o primer universal, 15 áreas pertencentes a cinco fazendas foram positivas para a presença do DNA de nematoides.
Já as análises com primers genes específicos revelaram que seis áreas, restritas a duas fazendas (Itaueira e Mata Fresca), foram confirmadas com a presença de R.
reniformis.
Apenas nove dos 20 iniciadores RAPD foram selecionados para a análise de diversidade, os quais geraram 67 bandas polimórficas (95,71 %) e três monomórficas (4,29%), evidenciando assim um alto polimorfismo, perfazendo uma média de 7,4 bandas polimórficas por iniciador.
O iniciador com maior número de bandas polimórficas foi o OPAA-04 com 11 bandas enquanto o OPA-03 foi o iniciador que apresentou o menor número (5).
Um dendrograma foi construído pelo método hierárquico UPGMA.
Utilizando um ponto de corte de 0,55, verificou-se dois grupos.
O primeiro formado pelas fazendas Iraueira e Mata Fresca e o segundo grupo pelas demais fazendas.
As estimativas de correlação cofenética, estresse e distorção indicaram que o agrupamento foi eficiente e com pequena perda de informação.
Já para o dendrograma obtido a partir de 51 amostras de R.
reniformis, observou-se a formação de seis grupos.
O maior grupo formado foi o V, contemplando 34 amostras, aproximadamente 66,7%.
A correlação cofenética foi estimada em 0,77%.
Verificou-se que o estudo não indicou nenhuma associação entre as magnitudes das dissimilaridades e a origem das amostras.
Verificou-se que o maior (0,92) e o menor (0,27) valor de similaridade encontrado foi entre amostras pertencentes à Fazenda Itaueira.
O estudo indica que há variabilidade entre as amostras com um coeficiente médio de dissimilaridade de 0,63 e um coeficiente de variação 14,88%.
Este é o primeiro estudo da variabilidade genética com marcadores moleculares realizado com amostras oriundas de campos de produção da principal região exportadora de melão no Brasil.

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