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Identificación eventos de splicing alternativo en situaciones de estrés salino en tomate (Solanum lycopersicum var MicroTom)
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El estrés abiótico afecta significativamente el desarrollo, la productividad y la supervivencia de las plantas, siendo el estrés salino uno de los factores más limitantes para el crecimiento de los cultivos y la calidad de los frutos en especies como el tomate. El cambio climático ha agravado este problema al expandir los suelos salinos a nivel mundial. Como respuesta adaptativa, las plantas modulan la expresión génica mediante mecanismos como el splicing alternativo (AS), un proceso post-transcripcional clave que aumenta la diversidad del transcriptoma y del proteoma.Este estudio tuvo como objetivo analizar el papel del splicing alternativo en la regulación de la arquitectura radicular en respuesta al estrés salino en tomate (Solanum lycopersicum cv. Micro-Tom). Para ello, se caracterizaron cambios fenotípicos en la radícula a los 8 días post-germinación tras un tratamiento combinado de inhibidor de AS y estrés salino (150 mM NaCl) durante una semana. Los resultados mostraron que el tratamiento combinado redujo la longitud de las raíces laterales, lo que sugiere una estrecha relación entre los eventos de AS y la modulación de la respuesta de la planta al estrés salino como mecanismo de supervivencia.Además, los datos transcriptómicos de raíces de tomate bajo estrés salino permitieron identificar genes que presentan splicing alternativo diferencial en respuesta al tratamiento. Asimismo, se identificaron categorías funcionales enriquecidas bajo condiciones salinas, destacando genes relacionados con el transporte de auxinas, los cuales fueron seleccionados como candidatos para validaciones futuras.
Title: Identificación eventos de splicing alternativo en situaciones de estrés salino en tomate (Solanum lycopersicum var MicroTom)
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El estrés abiótico afecta significativamente el desarrollo, la productividad y la supervivencia de las plantas, siendo el estrés salino uno de los factores más limitantes para el crecimiento de los cultivos y la calidad de los frutos en especies como el tomate.
El cambio climático ha agravado este problema al expandir los suelos salinos a nivel mundial.
Como respuesta adaptativa, las plantas modulan la expresión génica mediante mecanismos como el splicing alternativo (AS), un proceso post-transcripcional clave que aumenta la diversidad del transcriptoma y del proteoma.
Este estudio tuvo como objetivo analizar el papel del splicing alternativo en la regulación de la arquitectura radicular en respuesta al estrés salino en tomate (Solanum lycopersicum cv.
Micro-Tom).
Para ello, se caracterizaron cambios fenotípicos en la radícula a los 8 días post-germinación tras un tratamiento combinado de inhibidor de AS y estrés salino (150 mM NaCl) durante una semana.
Los resultados mostraron que el tratamiento combinado redujo la longitud de las raíces laterales, lo que sugiere una estrecha relación entre los eventos de AS y la modulación de la respuesta de la planta al estrés salino como mecanismo de supervivencia.
Además, los datos transcriptómicos de raíces de tomate bajo estrés salino permitieron identificar genes que presentan splicing alternativo diferencial en respuesta al tratamiento.
Asimismo, se identificaron categorías funcionales enriquecidas bajo condiciones salinas, destacando genes relacionados con el transporte de auxinas, los cuales fueron seleccionados como candidatos para validaciones futuras.
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