Identification de signatures biologiques pour la stratification des patients atteints de maladies auto-immunes systémiques

Les maladies auto-immunes telles que la maladie de Sjögren (SjD) et le lupus érythémateux systémique (LES) posent des défis majeurs liés à une grande hétérogénéité clinique et biologique. Au travers d’analyses multi-omiques, cette thèse présente des objectifs multiples : (i) Caractériser le profil clinique et biologique des patients atteints de SjD selon leur profil d’auto-anticorps, (ii) Créer un outil en ligne facilitant l'accès et l'interprétation des données de transcriptomique du LES, et (iii) Analyser les interactions cellulaires dans le tissu rénal du LES. Dans la SjD, la stratification selon les autoanticorps anti-Ro60/SSA et anti-Ro52/TRIM21 est corrélée avec une maladie plus sévère, en fonction de la signature IFN. De plus, un outil d’analyse de résultats de transcriptomique sanguine en ligne a été mis en place dans le LES, permettant de faciliter la réutilisation des données. Enfin, des analyses phénotypiques multiplexées couplées à de la transcriptomique spatiale ont permis de mettre en évidence la complexité du microenvironnement de la néphropathie lupique, avec l’identification de différentes cibles potentielles d’intérêt. Ces résultats soulignent le rôle des technologies « -omiques » pour identifier des signatures biologiques spécifiques ayant des répercussions diagnostiques, thérapeutiques et pronostiques majeures pour la meilleure prise en charge des patients atteints de maladies auto-immunes systémiques.