La réponse au stress chez les bactéries : réponse au stress métallique chez Pseudomonas putida et au stress rencontré en cours d’infection de plante chez le phytopathogène Dickeya dadantii

Les bactéries environnementales font face à de très nombreux stress dans leur milieu devie. Ces dernières doivent s’acclimater rapidement pour faire face à des variations detempérature, des changements d’osmolarité, des changements de pH ou encore descarences nutritives afin de survivre et de prospérer dans leur environnement naturel. Cetravail de thèse s’inscrit dans l’étude de la réponse aux stress chez les bactériesenvironnementales en prenant l’exemple du stress engendré par les métaux chez labactérie modèle Pseudomonas putida et du stress rencontré en cours d’infection deplante chez le phytopathogène Dickeya dadantii. La présence d’un excès d’ionsmétalliques ainsi que les défenses d’une plante sur un phytopathogène entrainent toutdeux un stress oxydatif et peut provoquer une altération membranaire ainsi queprotéique. Ces stress, à première vue éloignés, pourraient ainsi induire des mécanismesde réponses similaires chez les bactéries. La plupart des études de résistance aux stresschez les bactéries portent sur l’étude de gènes sur ou sous exprimés et peuvent alorsmanquer des gènes importants pour la réponse à un stress donné dont l’expressionreste inchangée. Afin d’identifier de nouveaux facteurs de résistance aux stressmétalliques chez P. putida ainsi que de nouveaux facteurs de résistance/virulence chezle phytopathogène D. dadantii, un crible Tn-seq (Transposon-Sequencing) a été réalisé àl’aide de banques de mutants très denses. Les deux cribles ont permis de mettre enévidence le rôle majeur de régulateurs de transcription ainsi que l’importance desmécanismes d’efflux dans la réponse à un stress. Les deux cribles ont aussi mis enévidence l’importance des voies de biosynthèses en acides aminées et acides nucléiques.Enfin, de nombreux gènes à fonction inconnue participent à la survie des deux bactériesen condition de stress. Les résultats obtenus pourraient permettre de développer denouveaux antimicrobiens chez D. dadantii. Les mécanismes de résistance aux métaux etaux antibiotiques peuvent être similaires. Nos travaux améliorent la compréhension desmécanismes de résistance aux métaux et pourraient ainsi permettre de trouver denouvelles molécules à activité antimicrobienne