Extrémités 3’ de l’ARN du Virus de l’Hépatite C : structures et Rôles dans la réplication du génome

Le génome du virus de l’Hépatite C est constitué d’un ARN monocaténaire linéaire de polarité positive (+). Les interactions ARN-ARN prennent une place essentielle dans la régulation du cycle viral.La synthèse de l’ARN est réalisée par l’ARN-polymérase ARN-dépendante (RdRp) codée par le virus. Elle serait initiée à l’extrémité 3’ des molécules à répliquer. Un ARN génomique complémentaire de polarité négative (-) est d’abord synthétisé. Il sert ensuite de matrice pour la production des brins génomiques. Les mécanismes qui président au recrutement de la polymérase et à l’initiation de la synthèse d’ARN restent, aujourd’hui, mal connus.Les structures ARN présentes aux extrémités 3’ et leurs rôles ont donc étés étudiés au cours des travaux de cette thèse. Au niveau de l’extrémité 3’ de l’ARN (+), la dimérisation a été montrée indispensable à la réplication du virus in cellulo. Ces travaux ont par la suite permis de caractériser par gel retard et cryo-microscopie la dimérisation des ARN génomiques en solution. Au niveau de l’extrémité 3’ de l’ARN (-), la dimérisation de deux molécules a également pu être caractérisée par des approches biochimiques et biophysiques. Par ailleurs la présence d’un G-quadruplex introduit un remaniement conformationnel qui se révèle indispensable à une synthèse performante de l’ARN. De manière similaire au brin génomique, la dynamique structurale résultante de ces interactions semble donc nécessaire à une réplication efficace de l’ARN par la RdRp.Les résultats obtenus soulignent l’importance de la dimérisation et des variations conformationnelles prisent aux extrémités 3’ pour la réplication de l’ARN. Ces données ouvrent alors la voie vers de nouvelles perspectives quant à la compréhension des mécanismes qui président au fonctionnement de la polymérase du VHC.