Analisis Variasi Genotipik Bawang Merah | Allium cepa L.| Di Pulau Jawa Menggunakan Penanda ISSR

Bawang merah (Allium cepa L.) merupakan salah satu komoditas unggulan pertanian di Indonesia karena produksinya yang tinggi. Nilai ekonomi bawang merah yang diekspor mencapai 6,53 juta USD per tahun dan terus mengalami peningkatan hingga satu dekade terakhir, dan menjadikan Indonesia sebagai negara eksportir peringkat keeempat di ASEAN. Bawang merah dihasilkan di 24 dari 34 provinsi di Indonesia, dengan kontribusi produksi terbesar di pulau Jawa (Pusat Data dan Sistem Informasi Pertanian, 2023). Variasi genotipik bawang merah merupakan salah satu penentu kualitas produksi bawang merah. Penelitian ini bertujuan untuk menganalisis variasi genotipik dua belas kultivar bawang merah di Pulau Jawa. Metode PCR-ISSR dengan 5 primer acak (ISSRred20, ISSRed4,ISSRed9,UBC892, dan UBC-895) digunakan untuk mengevaluasi variasi genotipik Allium cepa L. Tingkat kemiripan genetik antar kultivar ditentukan dengan Simple Matching Coefficient, dan analisis klaster untuk menghasilkan dendrogram yang menunjukkan kekerabatan fenetik dikerjakan menggunakan metode UPGMA. Hasil amplifikasi DNA genomik menggunakan lima primer menghasilkan 40 fragmen DNA yang terdiri dari 12 fragmen DNA monomorfik dan 28 fragmen DNA polimorfik. Variasi genotipik diantara 12 kultivar bawang merah pulau jawa sebesar 44,1% dengan kategori keanekaragaman yang sedang karena diantara 40-60% similiaritasnya. Kultivar Bauji, Bima, Katumi, Kramat2, Trisula, Kramat1, Pikatan dan Tiron dengan nilai similaritas 64,6% sedangkan kultivar Sembrani, Maja Cipanas, Mentes dan Pancasona dengan nilai similaritas 66,7%. Implikasi penelitian ini mampu menjadi dasar untuk perakitan bibit unggul kultivar bawang merah di Indonesia yang dapat mendukung ketahanan pangan nasional dimasa kini dan mendatang.