Utilisation des outils innovants de pointe pour l’identification des arthropodes d’intérêt médical et vétérinaire ainsi que la détection de leurs microorganismes associés

La première partie de cette thèse est consacrée sur une revue de la littérature portant sur les maladies transmises par les tiques chez l’homme et l’animal en Union des Comores. Les tiques étant vecteurs de plusieurs agents pathogènes, constituent une sérieuse menace en santé publique. Dans ce travail, nous avons utilisé une approche One health afin de rendre accessible l’ensemble des données concernant les maladies déjà décrites aux Comores ainsi que leurs tiques associées. Plusieurs maladies notamment des maladies bactériennes (Rickettsioses, Anaplasmoses et ehrlichioses), protozoaires (Théileriose, Babésioses) et virales (Encéphalite à tique) ont été déjà rapportées dans le territoire avec des prévalences non négligeables. L’apparition de la plupart de ces maladies, particulièrement celles d’origine vétérinaires proviennent suite aux importations d’animaux vivants de la République de la Tanzanie vers l’Union des Comores.Dans la seconde partie, nous nous sommes intéressés sur l’efficacité de l’outil MALDI-TOF MS à identifier les arthropodes. Dans un premier temps, nous avons évalué cet outil sur des échantillons (tiques) dont la durée de conservation en alcool 70% est >10ans en développant deux protocoles nommés PreDO et ReDO respectivement pour les tiques en alcool et ceux dont l’alcool s’est évaporé donc considéré sec. Les resultats obtenus dans cette étude nous ont permis de conclure que l’identification des arthropodes conservés en alcool par cet outil ne dépend pas de la durée de conservation mais plutôt des paramètres du protocole utilisé. Ensuite, dans un second temps, nous avons évalué cet outil pour identifier les 2 espèces de punaises de lit, notamment Cimex lectularius et Cimex hemipterus à leurs stades de developpement ainsi que la discrimination des stades de developpement proprement dit de chaque espèce.Dans la troisième partie, nous nous sommes focalisés sur la recherche des microorganismes associés aux arthropodes. D’abords sur des punaises de lit collectées aux Comores, nous avons recherché des microorganismes susceptibles de les parasités par des méthodes moléculaires. Seule Wolbachia endosymbionte a été detecté. A noté aussi que cette étude, est la premiére à décrire l’espèce de C. hemipterus comme étant la punaise de lit parasitant les maisons infesté aux Comores. D’autres part, nous nous sommes intéressés aux microorganismes associés aux tiques des Comores . Actuellement cette étude est en cours, mais les résultats du screening obtenus jusqu’aujourd’hui nous ont révélés des spécimens d’A. variegatum positif à des rickettsia sp ainsi que la détection de l’espèce de R. evertsi evertsi, une tique signalée pour la premiere fois en 2011 sur des animaux en provenance de la Tanzanie et jamais retrouvée sur d’autres études.Mots clés : Arthropodes, MALDI-TOF MS, microorganismes, Union des Comores, zoonoses