Biogeochemical functioning of transitional ecosystems colonised by electrical cable bacteria : benthic foraminiferal biocenosis and thanatocoenosis response

Fonctionnement biogéochimique des écosystèmes transitionnels colonisés par les bactéries filamentaires électriques : réponse des biocénoses et thanatocénoses de foraminifères benthiques L’objectif de cette thèse est d’évaluer l’effet de l’acidification provoquée par l’activité des cable bacteria sur la géochimie du sédiment des environnements intertidaux, et les conséquences de ce processus de dissolution sur les communautés de foraminifères benthiques et la préservation de leur test dans les sédiments. Cette étude combine des campagnes de suivis de vasières intertidales dans différents estuaires de la façade atlantique et de la Manche (France) par des approches à haute résolutions et des incubations en conditions contrôlées au laboratoire. L’activité des cable bacteria présente une variabilité saisonnière, avec un maximum d’activité durant la période été-automne, et tend à fortement structurer la succession verticale des zones oxique-suboxique-anoxique. La bioturbation associée à la macrofaune ou au réseau racinaire des zostères introduit de l’hétérogénéité latérale dans la géochimie et génère des microhabitats. L’effet structurant du pH sur la distribution successive des différentes espèces de foraminifères dans le sédiment a été mise en évidence. La réponse des foraminifères à l’acidification de leur environnement apparait espèce-dépendante et implique autant leur particularité métabolique que comportementale.L’activité des cable bacteria engendre une perte importante des tests carbonatés dans l’enregistrement sédimentaire. Leur temps de résidence est estimé à une douzaine de jours.L’accumulation de tests agglutinés et de membranes organiques, à défaut des tests carbonatés, pourraient être utilisée pour fournir une revue historique des processus de dissolution dans les sédiments marins.