Interactions between bacterial and fungal communities intestines and malaria and enteric pathogens eukaryotes in children in the Dogon Country (Mali)

Interactions entre les communautés bactériennes et fongiques intestinales et le paludisme et des pathogènes entériques eucaryotes chez des enfants au pays Dogon (Mali) Le microbiome contrôlerait les infections à Plasmodium chez l’homme. Le but était d’évaluer l’effet du microbiote bactérien et fongique sur l’infection asymptomatique et clinique à P. falciparum chez les enfants à Bandiagara, Mali. L’analyse métagénomique des bactéries et des champignons ont été effectuées sur les selles collectées au début de l’étude de cohorte de 300 enfants de 0 à 15 ans suivis durant 16 mois. Les cas d’infection clinique et asymptomatique à Plasmodium ont été analysés par la goutte épaisse et la qPCR respectivement. La richesse en bactérie était plus élevée chez les enfants infectés par P. falciparum. Le risque du paludisme était accru chez les enfants ayant plus d’OTUs en bactérie et aussi chez les enfants de 5 à 15 ans. La structure de la communauté des bactéries du tube digestif des enfants infectés et non par P. falciparum était significativement différente. Les enfants ayant l’accès palustre étaient plus abondants en Bifidobacterium faecale, Bifidobacterium_longm_subsp_suillum, Weissela confusa, Peptostreptococcaceae sp., Dorea longicatena, Dorea timonensis et Streptococcus timonensis. La communauté fongique, les indices de richesse et de diversité chez les enfants infectés et non par P. falciparum ont été similaires. En outre, le Blastocystis était associé à une diversité plus élevée de la communauté des bactéries chez les enfants sains et sans association avec les bactéries potentiellement pathogènes. En conclusion, le microbiote est susceptible à l’infection asymptomatique et clinique à P. falciparum et suggère que les manipulations de la composition du microbiote intestinal peuvent ouvrir à des voies de contrôle du paludisme