Ticks and tick-borne diseases in Cambodia

Les tiques et les maladies transmises par les tiques au Cambodge Les tiques et les maladies vectorielles à tiques sont une menace pour la santé publique et animale dans le monde. Seulement, d'importantes lacunes subsistent dans leurs connaissances au Cambodge. Cette thèse présente la première étude scientifique dédiée aux espèces de tiques présentes au Cambodge et aux agents pathogènes transmis par les tiques. Cette thèse combine une synthèse bibliographique de la littérature internationale et nationale, l'analyse de deux échantillonnages complémentaires - temporel et spatial- sur le terrain ainsi que l'utilisation de plusieurs méthodes pour la détection d'agents pathogènes. Un total de 21139 tiques a été prélevé sur 1093 animaux, appartenant à 13 espèces différentes. Ces hôtes étaient principalement du bétail et des animaux de compagnie, mais aussi quelques animaux de la faune sauvage. De plus, 11384 tiques ont été prélevées dans la végétation par les techniques du drapeau et du drap. Au total, 15 espèces de tiques ont été identifiées, dont sept n'avaient jamais été recensées au Cambodge : Carios batuensis, Dermacentor steini, D. filippovae, Haemaphysalis canestrinii, H. formosensis, H. hystricis et H. wellingtoni. Une sérologie réalisée sur 109 vaches a révélé un taux de séropositivité de 93,6 % pour au moins un agent pathogène : Anaplasma, Ehrlichia, Babesia ou Theileria. La détection moléculaire par PCR sur 352 pools de tiques a permis de détecter Anaplasma marginale (1,1%), Ehrlichia minasensis (0,9%), A. platys (0,3%) et des souches non identifiées de Babesia canis (2,0%), Anaplasma spp. (6,6%), Ehrlichia spp. (1,7%) et Babesia spp. (0,9 %). Enfin, les endosymbiontes de type Coxiella étaient présents dans 15,3 % des échantillons tandis que les pathogènes Coxiella spp. étaient rares et présents seulement dans 0,3 % des échantillons. Le séquençage de nouvelle génération (NGS) de 40 tiques récupérées sur bovins a révélé la présence de cinq virus déjà décrits : Guangdong Manly virus, Jingmen tick virus, Mogiana tick virus, Rhipicephalus-associated rhabdo-like virus et Zhangzhou totiv tick virus 1. Les tendances saisonnières indiquent que les infestations du bétail sont plus importantes pendant la saison sèche et atteignent leur maximum au début de la saison des pluies. Plus de tiques adultes ont été prélevées sur les hôtes, comparativement aux stades immatures. Les tiques étaient le plus souvent attachées aux oreilles ou au cou du bétail. Tous les résultats ont permis de préciser la meilleure période et localisation sur le bétail pour des traitements ciblés afin d'améliorer l'efficacité des traitements. Notre étude améliore la compréhension de la diversité des tiques et de la circulation des agents pathogènes transmis par les tiques sur les animaux au Cambodge. Malgré les difficultés rencontrées, telles que l'accès restreint aux forêts, les contraintes logistiques et la caractérisation incomplète des agents pathogènes, ces résultats établissent une base essentielle pour une possible surveillance. La non inclusion de données humaines en raison d'obstacles liés au consentement des patients souligne la nécessité de mener des études intégrées sur l'homme et l'animal, d'améliorer les méthodes de diagnostic (telles que la PCR multiplex et la sérologie) et d'initiatier des surveillances ciblées. Ces étapes sont essentielles pour orienter les stratégies de prévention fondées sur des données probantes et pour atténuer les menaces émergentes liées aux maladies vectorielles à tiques au Cambodge, avec une approche intégrée.