Search engine for discovering works of Art, research articles, and books related to Art and Culture
ShareThis
Javascript must be enabled to continue!

Variasi Gen matK dan Filogenetik Tumbuhan Kantong Semar (Nepenthes sp.) dari Gunung Mahawu dan Gunung Soputan di Sulawesi Utara (The Variation of matK Gene and the Phylogeny of Nepenthes sp. Obtained from Mount Mahawu and Mount Soputan in North Sulawesi)

View through CrossRef
Abstrak Kantong semar (Nepenthes sp.) merupakan salah satu tumbuhan langka yang dilindungi. Eksploitasi yang berlebihan, serta alih fungsi hutan menjadi ancaman bagi kehidupan Nepenthes sp. Penelitian ini bertujuan untuk menentukan variasi gen matK dari tumbuhan Nepenthes sp. di Gunung Mahawu (JTM) dan Gunung Soputan (JTS) di Sulawesi Utara dan membandingkannya dengan kerabat terdekat di GenBank, serta membuat pohon filogenetiknya. Hasil penelitian menunjukkan bahwa hanya terdapat satu perbedaan nukleotida sekuens gen matK antara Nepenthes sp. dari Gunung Mahawu dan Gunung Soputan. Selain itu, variasi juga ditunjukan pada Nepenthes sp. yang diperoleh dari basis data GenBank dengan adanya perbedaan 1-7 basa nukleotida dengan sampel penelitian ini. Hasil analisis menggunakan ABGD (Automatic Barcode Gap Discovery) menunjukkan bahwa variasi intraspesies untuk Nepenthes sp. berada dalam rentang 0,000 – 0,004. Apabila mempertimbangkan barcode gap tersebut sebagai pembatas spesies, maka diasumsikan bahwa JTM, JTS, N. fusca, N. pilosa, N. maxima, N. faizaliana, dan N. clipeata merupakan spesies yang sama. Hal ini ditunjang oleh rekonstruksi pohon filogenetik menggunakan gen matK.Kata Kunci: ABGD, barcode gap, gen matK, Nepenthes sp., pohon filogenetik, variasi sekuens. Abstract Tropical pitcher plant (Nepenthes sp.) is listed as one of the endangered and protected plants. Excessive exploitation and forest conversion threaten the life of this Nepenthes sp. This research was aimed to determine variation in matK gene of Nepenthes sp. obtained from Mount Mahawu (JTM) and Mount Soputan (JTS) North Sulawesi, and compare the matK sequences with their allied taxa in public domain data base. Analysis of matK gene showed that there was only one nucleotide difference of matK gene sequence between Mahawu and Soputan samples. There were 1-7 different nucleotides between those samples and their allied taxa. Analysis of barcode gap using ABGD (Automatic Barcode Gap Discovery) showed that the range of intraspecies variation of Nepenthes sp. was 0,000 – 0,004. Considering this barcode gap generated from ABGD as species delimination, it could be assumed that JTM, JTS, N. fusca, N. pilosa, N. maxima, N. faizaliana, dan N. clipeata were the same species. These results were also supported by the reconstruction of phylogenetic tree using matK gene.Keywords: ABGD, barcode gap, matK gene, Nepenthes sp., phylogeneteic tree, sequence variation. 
Title: Variasi Gen matK dan Filogenetik Tumbuhan Kantong Semar (Nepenthes sp.) dari Gunung Mahawu dan Gunung Soputan di Sulawesi Utara (The Variation of matK Gene and the Phylogeny of Nepenthes sp. Obtained from Mount Mahawu and Mount Soputan in North Sulawesi)
Description:
Abstrak Kantong semar (Nepenthes sp.
) merupakan salah satu tumbuhan langka yang dilindungi.
Eksploitasi yang berlebihan, serta alih fungsi hutan menjadi ancaman bagi kehidupan Nepenthes sp.
Penelitian ini bertujuan untuk menentukan variasi gen matK dari tumbuhan Nepenthes sp.
di Gunung Mahawu (JTM) dan Gunung Soputan (JTS) di Sulawesi Utara dan membandingkannya dengan kerabat terdekat di GenBank, serta membuat pohon filogenetiknya.
Hasil penelitian menunjukkan bahwa hanya terdapat satu perbedaan nukleotida sekuens gen matK antara Nepenthes sp.
dari Gunung Mahawu dan Gunung Soputan.
Selain itu, variasi juga ditunjukan pada Nepenthes sp.
yang diperoleh dari basis data GenBank dengan adanya perbedaan 1-7 basa nukleotida dengan sampel penelitian ini.
Hasil analisis menggunakan ABGD (Automatic Barcode Gap Discovery) menunjukkan bahwa variasi intraspesies untuk Nepenthes sp.
berada dalam rentang 0,000 – 0,004.
Apabila mempertimbangkan barcode gap tersebut sebagai pembatas spesies, maka diasumsikan bahwa JTM, JTS, N.
fusca, N.
pilosa, N.
maxima, N.
faizaliana, dan N.
clipeata merupakan spesies yang sama.
Hal ini ditunjang oleh rekonstruksi pohon filogenetik menggunakan gen matK.
Kata Kunci: ABGD, barcode gap, gen matK, Nepenthes sp.
, pohon filogenetik, variasi sekuens.
Abstract Tropical pitcher plant (Nepenthes sp.
) is listed as one of the endangered and protected plants.
Excessive exploitation and forest conversion threaten the life of this Nepenthes sp.
This research was aimed to determine variation in matK gene of Nepenthes sp.
obtained from Mount Mahawu (JTM) and Mount Soputan (JTS) North Sulawesi, and compare the matK sequences with their allied taxa in public domain data base.
Analysis of matK gene showed that there was only one nucleotide difference of matK gene sequence between Mahawu and Soputan samples.
There were 1-7 different nucleotides between those samples and their allied taxa.
Analysis of barcode gap using ABGD (Automatic Barcode Gap Discovery) showed that the range of intraspecies variation of Nepenthes sp.
was 0,000 – 0,004.
Considering this barcode gap generated from ABGD as species delimination, it could be assumed that JTM, JTS, N.
fusca, N.
pilosa, N.
maxima, N.
faizaliana, dan N.
clipeata were the same species.
These results were also supported by the reconstruction of phylogenetic tree using matK gene.
Keywords: ABGD, barcode gap, matK gene, Nepenthes sp.
, phylogeneteic tree, sequence variation.
 .

Related Results

Komposisi serangga yang terperangkap pada kantong atas dan kantong bawah Nepenthes rafflesiana di Sungai Koran Resort, Sebangau Hulu
Komposisi serangga yang terperangkap pada kantong atas dan kantong bawah Nepenthes rafflesiana di Sungai Koran Resort, Sebangau Hulu
Sungai Koran Resort di Sebangau Hulu merupakan daerah hutan yang terbuka dengan tingkat kelembaban yang rendah sehingga pada daerah tersebut banyak ditemui tanaman kantong semar kh...
Estrategias de transmisión de digeneos parásitos que utilizan gasterópodos como hospedadores intermediarios en la costa patagónica
Estrategias de transmisión de digeneos parásitos que utilizan gasterópodos como hospedadores intermediarios en la costa patagónica
En el siguiente trabajo se describieron los estadios larvales de los digeneos parásitos presentes en los gasterópodos más abundantes de los intermareales de Puerto Madryn, Chubut (...
Keanekaragaman Tumbuhan Berguna di Kawasan Hutan Bodogol, Taman Nasional Gunung Gede Pangrango
Keanekaragaman Tumbuhan Berguna di Kawasan Hutan Bodogol, Taman Nasional Gunung Gede Pangrango
Kemajuan teknologi di bidang farmakologi tidak hanya menguatkan dominasi obat modern yang berbasis bahan kimia anorganik, back to nature dengan pengobatan herbal selama dua dekade ...
Perilaku Konsumen terhadapPenggunaan Kantong Plastik dan Tas Kain di Area Jabodetabek
Perilaku Konsumen terhadapPenggunaan Kantong Plastik dan Tas Kain di Area Jabodetabek
Penelitian bertujuan untuk menguji Theory of Planned Behavior dalam konteks keinginan individu dalam mengurangi penggunaan kantong plastik, yaitu hubungan antara kesadaraan ...
Distribusi Nepenthes spp. di Hutan Kalampangan
Distribusi Nepenthes spp. di Hutan Kalampangan
Kalampangan peat swamp forests in Central Kalimantan is home for Nepenthes spp. However, the number of Nephentes has been reduced due to massive forest fires and land conversion fo...
Analisis Kinerja Kantong Lumpur (Sandtrap) Daerah Irigasi Sragi
Analisis Kinerja Kantong Lumpur (Sandtrap) Daerah Irigasi Sragi
Penelitian ini bertujuan untuk menghitung efektivitas desain rencana terhadap kondisi eksistingnya. Penelitian dilakukan di Daerah Irigasi Sragi yang terletak di Desa Brondong, Kec...
Studi Literatur Potensi Aktivitas Antidepresan dari Tumbuhan Suku Valerianaceae
Studi Literatur Potensi Aktivitas Antidepresan dari Tumbuhan Suku Valerianaceae
Abstract. The plants of Valerianaceae Family is a medicinal plant that has potential as an antidepressant. One of the sesquiterpenoid content of the Valerianaceae Family is valeran...
Species of Nepenthes (Pitcher Plant) in Selected Areas of San Isidro, Northern Samar
Species of Nepenthes (Pitcher Plant) in Selected Areas of San Isidro, Northern Samar
Nepenthes is a genus in the Nepenthaceae family of the order Nepenthales that is also known as a carnivorous plant. Thus, a study was conducted to identify the diversity of Nepenth...

Back to Top