Etudes structurales d'un complexe HOX-PBC de drosophile. : Un exemple de régulateur transcriptionnel.

Les protéines Hox sont des protéines à homéodomaine. Elles sont très conservées et impliquées dans l'identité cellulaire selon les axes antéropostérieur, dorsoventral et proximodistal. Elles reconnaissent l'ADN pour réguler l’expression des gènes. La coopérativité avec des partenaires de la famille PBC est un modèle pour l'amélioration de la spécificité. Cette étude utilise Ubx (Hox) et Exd (PBC) de D. melanogaster comme modèles. Deux modes d'interaction entre Ubx et Exd : un par le motif « hexapeptide » d'Ubx et un autre par le motif UbdA objet de ce travail. UbdA se situe en C-terminal de l'hélice de reconnaissance de l'ADN d'Ubx. Nous avons résolu différentes structures de complexes Ubx-Exd-ADN avec deux types de séquences d'ADN. Ces structures montrent que le motif UbdA peut adopter différentes conformations permettant différents rôles : surface d'interaction avec Exd ou charnière entre l'HD et les domaines C-terminaux. En plus des motifs d'Ubx important pour la fonction de régulation, Ubx et Exd comportent des motifs intrinsèquement désordonnés appelés linker et bras N-terminal de l'homéodomaine, respectivement. Ces motifs interagissent avec l'ADN au niveau du sillon mineur et ont la capacité d'explorer l’environnement. Nous avons étudié l'extrémité en C-terminale d'Exd. Ce motif forme une quatrième hélice dont le repliement peut influer sur les contacts établis avec Ubx et avec l'ADN. L'ensemble de ces observations nous a permis d'apporter des éléments supplémentaires pour la compréhension de la spécificité de fonctions et de contribuer à alimenter les modèles de scannage de l'ADN de type monkey bar et d'« interface glissante ».