Javascript must be enabled to continue!
การโคลนและลักษณะสมบัติของยีนกลุ่ม rhl ที่เกี่ยวข้องกับการสังเคราะห์โมโนแรมโนลิพิดทางชีวภาพของ Pseudomonas aeruginosa A41 : รายงานผลการวิจัย
View through CrossRef
Pseudomonas sp. A41 ที่แยกจากน้ำทะเลอ่าวไทย มีความสามารถในการผลิตแรมโนลิพิดจากลักษณะทางสัณฐานวิทยาและสมบัติทางชีวเคมีร่วมกับข้อมูลลำดับนิวคลีโอไทด์ของ 16S rDNA สามารถจำแนกสายพันธุ์ A41 เป็น Pseudomonas aeruginosa แยกยีนที่เกี่ยวข้องกับการสังเคราะห์แรมโนลิพิดจาก Pseudomonas aeruginosa A41 โดยเทคนิคเซาท์เธอร์นไฮบริไดเซชันจีโนมิกดีเอ็นเอกับดีเอ็นเอติดตาม rhlR หรือ rhlA โคลนชิ้นดีเอ็นเอที่ให้ผลบวกเข้าในพลาสมิดเวกเตอร์และหาลำดับนิวคลีโอไทด์ของชิ้นดีเอ็นเอแทรกสอด จากลำดับนิวคลีโอไทด์ทั้งสิ้น 4,965 bp พบกรอบอ่านรหัสเปิด (ORF) ที่สมบูรณ์จำนวน 4 แห่ง และไม่สมบูรณ์ 1 แห่ง กรอบอ่านรหัสเปิดทั้งหมดมีทิศทางในการถอดรหัสไปในทางเดียวกันตามลำดับดังต่อไปนี้ ORF1 (dcd) เป็นกรอบอ่านรหัสเปิดที่ไม่สมบูรณ์ ลำดับกรดอะมิโนมีความคล้ายกับ deoxycytidine triphosphate deaminase ของ Pseudomonas aeruginosa PAO1 เท่ากับ100% ORF2 (rhIA) ลำดับกรดอะมิโนมีความคล้ายกับ rhamnosyltransferase 1 chain A ของ Pseudomonas aeruginosa PG201 เท่ากับ 100% ORF3 (rhIB) ลำดับกรดอะมิโนมีความคล้ายกับ rhamnosyltransferase 1 chain B ของ Pseudomonas aeruginosa PAO1 เท่ากับ 100% ORF4 (rhIR) ลำดับกรดอะมิโนมีความคล้ายกับ transcriptional regulator RhIR ของ Pseudomonas aeruginosa PAO1 และ Pseudomonas aeruginosa PG201 เท่ากับ 100% ORF5 (rhII) ลำดับกรดอะมิโนมีความคล้ายกับ autoinducer synthetase protein RhII ของ Pseudomonas aeruginosa PG201 เท่ากับ 94% นอกจากนี้ยังพบบริเวณโปรโมเตอร์ บริเวณจับเกาะของไรโบโซม และบริเวณอนุรักษ์ las box ซึ่งเป็นบริเวณจับเกาะของ regulatory protein เหนือกรอบอ่านรหัสเปิด ORF2 ORF4 และ ORF5
Title: การโคลนและลักษณะสมบัติของยีนกลุ่ม rhl ที่เกี่ยวข้องกับการสังเคราะห์โมโนแรมโนลิพิดทางชีวภาพของ Pseudomonas aeruginosa A41 : รายงานผลการวิจัย
Description:
Pseudomonas sp.
A41 ที่แยกจากน้ำทะเลอ่าวไทย มีความสามารถในการผลิตแรมโนลิพิดจากลักษณะทางสัณฐานวิทยาและสมบัติทางชีวเคมีร่วมกับข้อมูลลำดับนิวคลีโอไทด์ของ 16S rDNA สามารถจำแนกสายพันธุ์ A41 เป็น Pseudomonas aeruginosa แยกยีนที่เกี่ยวข้องกับการสังเคราะห์แรมโนลิพิดจาก Pseudomonas aeruginosa A41 โดยเทคนิคเซาท์เธอร์นไฮบริไดเซชันจีโนมิกดีเอ็นเอกับดีเอ็นเอติดตาม rhlR หรือ rhlA โคลนชิ้นดีเอ็นเอที่ให้ผลบวกเข้าในพลาสมิดเวกเตอร์และหาลำดับนิวคลีโอไทด์ของชิ้นดีเอ็นเอแทรกสอด จากลำดับนิวคลีโอไทด์ทั้งสิ้น 4,965 bp พบกรอบอ่านรหัสเปิด (ORF) ที่สมบูรณ์จำนวน 4 แห่ง และไม่สมบูรณ์ 1 แห่ง กรอบอ่านรหัสเปิดทั้งหมดมีทิศทางในการถอดรหัสไปในทางเดียวกันตามลำดับดังต่อไปนี้ ORF1 (dcd) เป็นกรอบอ่านรหัสเปิดที่ไม่สมบูรณ์ ลำดับกรดอะมิโนมีความคล้ายกับ deoxycytidine triphosphate deaminase ของ Pseudomonas aeruginosa PAO1 เท่ากับ100% ORF2 (rhIA) ลำดับกรดอะมิโนมีความคล้ายกับ rhamnosyltransferase 1 chain A ของ Pseudomonas aeruginosa PG201 เท่ากับ 100% ORF3 (rhIB) ลำดับกรดอะมิโนมีความคล้ายกับ rhamnosyltransferase 1 chain B ของ Pseudomonas aeruginosa PAO1 เท่ากับ 100% ORF4 (rhIR) ลำดับกรดอะมิโนมีความคล้ายกับ transcriptional regulator RhIR ของ Pseudomonas aeruginosa PAO1 และ Pseudomonas aeruginosa PG201 เท่ากับ 100% ORF5 (rhII) ลำดับกรดอะมิโนมีความคล้ายกับ autoinducer synthetase protein RhII ของ Pseudomonas aeruginosa PG201 เท่ากับ 94% นอกจากนี้ยังพบบริเวณโปรโมเตอร์ บริเวณจับเกาะของไรโบโซม และบริเวณอนุรักษ์ las box ซึ่งเป็นบริเวณจับเกาะของ regulatory protein เหนือกรอบอ่านรหัสเปิด ORF2 ORF4 และ ORF5.
Related Results
การโคลนและลักษณะสมบัติของยีนกลุ่ม rhl ที่เกี่ยวข้องกับการสังเคราะห์แรมโนลิพิดของ Pseudomonas aeruginosa A41
การโคลนและลักษณะสมบัติของยีนกลุ่ม rhl ที่เกี่ยวข้องกับการสังเคราะห์แรมโนลิพิดของ Pseudomonas aeruginosa A41
Pseudomonas sp. A41 ที่แยกจากอ่าวไทย มีความสามารถ1ในการผลิตแรมโนลิพิดจากลักษณะทางสัณฐานวิทยาและสมบัติทางชีวเคมีร่วมกับข้อมูลลำดับนิวคลีโอไทด์ของ 16S rDNA สามารถจำแนกลายพันธุ A41 เป...
Challenging Management of Postoperative Empyema: A Case Report with Literature Review
Challenging Management of Postoperative Empyema: A Case Report with Literature Review
Abstract
Introduction: Pleural empyema is the collection of pus within the pleural cavity, typically arising as a complication of pneumonia, chest trauma, thoracic surgery, or bact...
The Role Lnc‐RHL in Hepatic Cell Lineage Decisions and Proliferation in HepaRG Cells
The Role Lnc‐RHL in Hepatic Cell Lineage Decisions and Proliferation in HepaRG Cells
Long noncoding RNAs (lncRNAs) are functional transcripts with lengths of over 200 nucleotides that do not encode proteins. LncRNAs have received wide attention as key regulators of...
Metallothionein Protein Modeling from Pseudomonas aeruginosa PAO1 as A Metal Biosorber Candidate
Metallothionein Protein Modeling from Pseudomonas aeruginosa PAO1 as A Metal Biosorber Candidate
Metallothionein is a protein that is well known to play a role in metal metabolism in bacterial cells. Metallothionein is a multifunctional protein that has the potential to be use...
Multi-Factor Evaluation of RHL Success in Neniari Village, Indonesia
Multi-Factor Evaluation of RHL Success in Neniari Village, Indonesia
General Background: Forest and land rehabilitation (RHL) is essential for addressing critical land conditions, aiming to transform unproductive lands into areas that can enhance co...
rhl deficient-Pseudomonas aeruginosa induces enhanced host necroptosis through upregulation pqs within quorum sensing
rhl deficient-Pseudomonas aeruginosa induces enhanced host necroptosis through upregulation pqs within quorum sensing
Abstract
As the leading cause of nosocomial infections, the relationship between Pseudomoans aeruginosa (P. aeruginosa) and host innate immune responses still arouse...
2049. National Trends in Infections caused by Pseudomonas aeruginosa and Carbapenem Resistant Pseudomonas aeruginosa, 2017 – 2020
2049. National Trends in Infections caused by Pseudomonas aeruginosa and Carbapenem Resistant Pseudomonas aeruginosa, 2017 – 2020
Abstract
Background
Pseudomonas aeruginosa is an opportunistic pathogen commonly found in the environment, including water and p...
Prevalence and risk factors of
Pseudomonas aeruginosa
colonization
Prevalence and risk factors of
Pseudomonas aeruginosa
colonization
Abstract
Pseudomonas aeruginosa
(
P. aeruginosa
) is one of the most concerning pathogens d...

