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A IDENTIFICAÇÃO E CARACTERIZAÇÃO DA FAMILIA DE GENE 1,3-BETAGLUCOSIDASE DE MANIHOT ESCULENTA CRANTZ
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Introdução: A mandioca (Manihot esculenta, Crantz) é uma planta dicotiledônea, arbustiva, de crescimento perene e pertencente à família Euphorbiaceae, na qual tem uma característica de consumo familiar na região norte, e estão distribuídas em várias áreas do meio ambiente, fazendo que os mesmos fiquem expostas a vários fatores, como os estresses bióticos e abióticos. O presente trabalho vem retratar sobre a identificação de caracterização da família de gene 1,3-beta-glucosidase de Manihot Esculenta Crantz. Diante disso, a família de genes glucosidase vem ser importante para retardar o crescimento de fungos patogênicos e diminuir a deterioração dos fungos nos frutos causados pelos mesmo, além disso, a aplicação das glucosidases em controle biológico ocorre devido à composição da parede celular, no qual vem ser a localização subcelular das 1,3-beta-glucosidase nos micro-organismos que são patogênicos. Objetivo: Atrelado a isso, este estudo visa identificar e caracterizar in silico a família de genes 1,3 –beta-glucosidase de Manihot esculenta crantz, através de aspectos evolutivos possibilitando análises de suas atividades enzimáticas e biológicas. Material e métodos: As sequências genômicas dos genes da família de 1,3-beta-glucosidase da mandioca foram obtidas por meio das ferramentas de busca disponível no Phytozome, no qual mostrou 30 sequências genômica que compõe a família glucosidase, onde foram nomeadas de Mesidae1, Mesidae2 .... Mesidae30, entretanto, as 30 sequências estão dispostas em 19 cromossomos. Resultados: Através do programa InterProScan, foi possível analisar que os genes Mesidae2; Mesidae3 e Mesidae10 ambos apresentam 496pb. Já o Mesidae17; Messidae25 e Mesidae30, também irão apresentar uma à similaridade no número de pb, pois vão conter 658. Entretanto, o Mesidae21 e Mesidae28 vão ter 458pb. O Mesidae22 e Mesidae26, irão ter 528pb. Já os Mesidae23 e Mesidae27 vão ter 553 pb, respectivamente todas as sequências vão ter uma variação de 2 a 10 introns na sequência. Através do programa SWISS-MODEL, foi constatado observar o arranjo tridimensional das proteínas. Conclusão: Os resultados obtidos neste trabalho permitem concluir que a família 1,3-beta-glucosidase da Manihot esculenta crantz possui 30 isoformas, onde estas têm as características necessárias para serem consideradas famílias.
Revista Multidisciplinar de Educação e Meio Ambiente
Title: A IDENTIFICAÇÃO E CARACTERIZAÇÃO DA FAMILIA DE GENE 1,3-BETAGLUCOSIDASE DE MANIHOT ESCULENTA CRANTZ
Description:
Introdução: A mandioca (Manihot esculenta, Crantz) é uma planta dicotiledônea, arbustiva, de crescimento perene e pertencente à família Euphorbiaceae, na qual tem uma característica de consumo familiar na região norte, e estão distribuídas em várias áreas do meio ambiente, fazendo que os mesmos fiquem expostas a vários fatores, como os estresses bióticos e abióticos.
O presente trabalho vem retratar sobre a identificação de caracterização da família de gene 1,3-beta-glucosidase de Manihot Esculenta Crantz.
Diante disso, a família de genes glucosidase vem ser importante para retardar o crescimento de fungos patogênicos e diminuir a deterioração dos fungos nos frutos causados pelos mesmo, além disso, a aplicação das glucosidases em controle biológico ocorre devido à composição da parede celular, no qual vem ser a localização subcelular das 1,3-beta-glucosidase nos micro-organismos que são patogênicos.
Objetivo: Atrelado a isso, este estudo visa identificar e caracterizar in silico a família de genes 1,3 –beta-glucosidase de Manihot esculenta crantz, através de aspectos evolutivos possibilitando análises de suas atividades enzimáticas e biológicas.
Material e métodos: As sequências genômicas dos genes da família de 1,3-beta-glucosidase da mandioca foram obtidas por meio das ferramentas de busca disponível no Phytozome, no qual mostrou 30 sequências genômica que compõe a família glucosidase, onde foram nomeadas de Mesidae1, Mesidae2 .
Mesidae30, entretanto, as 30 sequências estão dispostas em 19 cromossomos.
Resultados: Através do programa InterProScan, foi possível analisar que os genes Mesidae2; Mesidae3 e Mesidae10 ambos apresentam 496pb.
Já o Mesidae17; Messidae25 e Mesidae30, também irão apresentar uma à similaridade no número de pb, pois vão conter 658.
Entretanto, o Mesidae21 e Mesidae28 vão ter 458pb.
O Mesidae22 e Mesidae26, irão ter 528pb.
Já os Mesidae23 e Mesidae27 vão ter 553 pb, respectivamente todas as sequências vão ter uma variação de 2 a 10 introns na sequência.
Através do programa SWISS-MODEL, foi constatado observar o arranjo tridimensional das proteínas.
Conclusão: Os resultados obtidos neste trabalho permitem concluir que a família 1,3-beta-glucosidase da Manihot esculenta crantz possui 30 isoformas, onde estas têm as características necessárias para serem consideradas famílias.
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