Implication des effecteurs TAL dans la pathogénie de Xanthomonas campestris pv. campestris chez le chou-fleur

La bactérie phytopathogène Xanthomonas campestris pv. campestris (Xcc) est l'agent causal de la pourriture noire, une maladie touchant les cultures de Brassicas telles que le chou-fleur, le radis, le navet et le colza. Parmi les facteurs de virulence majeurs connus chez les Xanthomonas, on trouve une famille d'effecteurs de type III connus sous le nom de Transcription Activator Like Effectors (TALEs). Ces protéines TALE sont injectées dans les cellules des plantes puis migrent vers le noyau, où elles modulent l'expression des gènes de l'hôte. Ces gènes sont appelés gènes de sensibilité (S) lorsqu'ils favorisent le développement de la maladie et la multiplication bactérienne. Bien que les TALEs et leurs cibles aient été largement caractérisés chez certaines espèces du genre Xanthomonas, leur rôle dans la virulence de Xcc reste en grande partie inexploré. À ce jour, aucune cible des TALEs de Xcc n'a été identifiée et caractérisée comme un gène S. Dans le cadre de ma thèse, je me suis focalisé sur l'implication des TALEs dans la pathogénie de Xcc. Mes recherches ont abouti à l'identification de cinq TALEs qui contribuent individuellement au développement de la maladie chez le chou-fleur, soulignant leur rôle crucial dans le processus infectieux. Parmi eux, le Tal12a se distingue par son implication tant dans la progression de la maladie que dans la croissance bactérienne au sein de la plante hôte. L'analyse transcriptomique des feuilles de chou-fleur infectées par des souches contenant Tal12a a révélé 380 gènes induits par cet effecteur. En intégrant ces résultats avec des prédictions in silico du site de liaison de Tal12a dans le génome du chou-fleur, sept cibles potentielles ont été identifiées : BoCYP450, BoERF043, BoATHB-X, BoIAA7a/b/c et BoTIC40, dont six semblent être directement régulées par Tal12a. De manière intéressante, l'analyse a également mis en évidence l'induction de deux gènes SWEET, dont les homologues dans d'autres pathosystèmes sont associés à la sensibilité des plantes aux infections. Ces découvertes soulèvent des questions intéressantes sur le rôle potentiel de ces gènes en tant que gènes S chez le chou-fleur. Des investigations complémentaires sont donc nécessaires pour élucider leur fonction et leur contribution à la sensibilité des plantes en réponse à Xcc. Ces résultats représentent la première évaluation exhaustive des rôles individuels des TALEs dans la pathogénicité de Xcc ainsi que la première identification de cibles spécifiques de ces TALEs chez le chou-fleur. L'importance de cette recherche réside dans sa contribution à une compréhension plus large des mécanismes moléculaires qui régissent la virulence médiée par les TALEs de Xcc chez une espèce cultivée de Brassica. En conclusion, ces résultats enrichissent non seulement notre compréhension fondamentale de la pathogénicité de Xcc, mais ouvrent également de nouvelles perspectives pour le développement de stratégies ciblées visant à améliorer la résistance des cultures de Brassicas.