Conséquences des extinctions d’espèces sur les pertes d’histoire évolutive

Du fait des activités humaines les espèces s’éteignent à un rythme si rapide qu’une sixième crise d’extinction a probablement débuté. Il est de plus probable que ces phénomènes d’extinction s’intensifient dans le futur. Néanmoins toutes les espèces ne peuvent être sauvées et les biologistes doivent faire des choix pour protéger au mieux la biodiversité. Un défi crucial est alors d’estimer et quantifier quelle biodiversité est menacée ainsi que de proposer des stratégies de conservation adaptées. Cette thèse s’intéresse aux conséquences des extinctions d’espèces sur l’histoire évolutive, principalement mesurée par des indices de diversité et d’originalité phylogénétique (la phylogénie représentant les relations évolutives entre espèces sous une forme proche de celle d’un arbre). Nous montrons comment les extinctions d’espèces peuvent appauvrir ‘l’arbre du vivant’ et mettons en avant pourquoi la conservation de l’histoire évolutive permettrait de réduire les conséquences des extinctions d’espèces sur la biodiversité. Nous analysons pour quels taxons et dans quelles régions du monde l’histoire évolutive est menacée. En particulier nous identifions les sites prioritaires du bassin méditerranéen, un point chaud de biodiversité, pour la conservation de la diversité et de l’originalité phylogénétique menacée de la région. Puis nous nous intéressons à deux risques peu étudiés sur les pertes d’histoire évolutive. Dans un premier temps nous estimons les possibles impacts des espèces à « Données insuffisantes » sur les pertes de diversité et d’originalité phylogénétique. Puis nous proposons une méthode pour mesurer les conséquences des co-extinctions sur l’histoire évolutive. Enfin nous discutons de projets et de recherche prometteurs pour inclure des critères de diversité et d’originalité phylogénétique dans les actions de conservation.