Implications des communautés bactériennes ferri-réductrices et des paramètres environnementaux dans le fonctionnement et la qualité des sols de rizières (Thaïlande et Côte d'Ivoire)

Ce travail a été effectué pour définir le rôle des bactéries ferri-réductrices sur la mobilisation du fer dans deux types de situations environnementales : l’une où les rizières sont soumises à la salinité et à des apports de matières organiques (Thaïlande) et l’autre où la toxicité ferreuse se développe fortement (Côte d’Ivoire). Diverses approches ont été adoptées allant de la caractérisation des sols et des eaux in situ à des études expérimentales au laboratoire en distinguant l’impact de divers paramètres (amendement organique, salinité, rhizosphère, teneur et nature des matières organiques des sols). Pour les sols de Thaïlande, les résultats montrent que la salinité limite la prolifération des communautés bactériennes. L’apport de matières organiques, même faible, améliore la croissance et les activités des communautés bactériennes dans les zones salines. Une adaptabilité à la salinité est observée pour diverses populations de bactéries constituant des consortia ferri-réducteurs cultivables ou non, comportant au moins 4 à 5 populations identifiées. Ces consortia possèdent, pour certains des populations ferri-réductrices communes à l’ensemble des conditions (salines vs non salines), des populations soit halotolérantes (Clostridium beijerinckii ; Bacillus sp. ; Oceanobacillus sp., Shewanella sp.), soit halophiles (Virgibacillus, Alkaliphilus metalliredigens, Bacillus megaterium), soit halosensibles, favorisant le maintien des activités dans des conditions de milieux variables. En Côte d’Ivoire, les conditions de milieu semble plus réductrices avec la présence d’une forte communauté bactérienne sulfato-réductrice (Desulfovribrio desulfuricans) et d’une forte communauté bactérienne ferri-réductrice, majoritairement fermentaire (Bacillus sp.), qui contribuerait efficacement à la réduction et solubilisation du fer. L’activité bactérienne ferri réductrice délétère en Côte d’Ivoire mais bénéfique en Thaïlande, apparaît comme un paramètre et un indicateur de la qualité des sols de rizières.