Les mycotoxines : stratégie de prélèvement et d’analyse

Les mycotoxines sont souvent suspectées d’être responsables d’accident toxique en élevage. Cependant, la démonstration de leur implication réelle est souvent délicate à cause de l’hétérogénéité quasi systématique de la contamination et aussi de la difficulté à interpréter les résultats des analyses. En effet, plusieurs types d’analyses peuvent être envisagées, chacune ayant un intérêt différent en fonction du contexte clinique et épidémiologique. La numération fongique globale permet le suivi d’un procédé de fabrication et l’identification d’une source (étape) de contamination L’identification des espèces fongiques présente est beaucoup plus pertinente mais aussi plus difficile car elle demande un haut niveau d’expertise. La nature des espèces fongiques présentes peut permettre de comprendre l’origine d’un accident toxique. C’est aussi la seule approche possible pour certaines espèces dont les toxines ne sont pas dosées en routine. Le dosage direct des mycotoxines est le plus souvent pratiqué. Cependant, la généralisation des méthodes de dosage “multi-toxines” rend souvent l’interprétation des résultats délicate par la mise en évidence de composés pour lesquels les données toxicologiques sont peu nombreuses. Certaines analyses biologiques, bien que souvent non spécifiques peuvent aussi aider à orienter le diagnostic. Dans tous les cas, l’étape d’échantillonnage est une étape clé qui doit tenir compte du contexte épidémiologique et des objectifs de l’analyse.