Cell cycle regulation by non-coding RNAs in Caulobacter crescentus

Etude de la régulation du cycle cellulaire par les ARN non codants dans l'organisme modèle Caulobacter crescentus Caulobacter crescentus est un organisme modèle pour l'étude de la régulation globale des gènes. Son cycle cellulaire asymétrique est régi par une cascade d’activation de régulateurs transcriptionnels. J'ai étudié la régulation post-transcriptionnelle de CtrA, un régulateur essentiel du cycle cellulaire. CtrA contrôle la réplication de l'ADN et l'expression de plus de 100 gènes impliqués dans des fonctions clés comme la méthylation de l'ADN ou la division cellulaire. Au cours du cycle cellulaire, deux vagues d'activation de CtrA ont lieu. La première vague implique l'expression du promoteur ctrA-P1 conduisant à sa faible accumulation. La deuxième implique la capacité de CtrA à se lier à son propre promoteur fort P2, conduisant à des niveaux plus élevés de CtrA. Cette deuxième vague peut être contrôlée par des mécanismes post-transcriptionnels médiés par des ARN non codants (ARNnc) jamais liés, à ce jour, aux régulateurs du cycle cellulaire chez C. crescentus. J'ai axé mes travaux sur l'ARNnc CcnA "Cell Cycle Non-coding RNA A" dont le gène est situé à l'origine de la réplication (Cori) potentiellement activé par CtrA. J'ai montré que CcnA se lie à la région 5' non traduite de ctrA-P2 régulant positivement sa traduction. J'ai montré que la transcription de CcnA est cruciale pour la progression du cycle cellulaire et la physiologie de Cori. De plus, j'ai saisi le targetome in vivo de CcnA, révélant qu'il a pour cible d'autres ARNm via la purification par affinité MS2 et le séquençage à haut débit (MAPS). Enfin, le rôle de CcnA apparaît conservé chez Sinorhizobium meliloti, suggérant un rôle clé éventuel de CcnA dans la régulation du cycle cellulaire des alphaproteobactéries.