Dynamiques intra- et interannuelles du régime alimentaire des carabes dans les champs de colza

Recourir au contrôle biologique des ravageurs des cultures par les prédateurs naturels peut permettre la réduction de l'usage des intrants chimiques, mais cela demande une bonne compréhension des réseaux trophiques et du rôle des prédateurs. Les carabes, prédateurs généralistes ayant de fortes diversité et abondances dans les agroécosystèmes, donnent l'opportunité d'étudier leur régime alimentaire et leur efficacité pour le contrôle biologique. L'objectif de cette thèse était d'analyser les interactions trophiques entre les carabes et leurs ressources animales ou végétales, ainsi que les dynamiques temporelles de ces interactions, afin de comprendre les dynamiques de la régulation des ravageurs et des adventices par les carabes. Nous avons eu recours à une approche par métabarcode ADN sur les contenus digestifs des carabes pour étudier leur régime alimentaire dans les champs de colza, en utilisant les marqueurs universels des animaux (COI) et des végétaux (ITS).Les pièges à fosse secs ont été utilisés sur l'hypothèse qu'ils permettent une meilleure préservation de l'ADN dans les échantillons. Nous avons testé l'effet de ce type de piège sur les résultats de séquençage en le comparant avec un piège classique chez deux espèces abondantes dans les champs de colza en automne. Globalement, les pièges secs permettent d'acquérir plus d'informations sur le régime alimentaire des carabes. Par ailleurs, les résultats montrent que ces deux espèces consomment en majorité des détritivores et des prédateurs en automne.Les dynamiques intra-annuelles du régime alimentaire des carabes ont été étudiées sur des carabes adultes de toute la communauté, capturés durant les printemps 2021 et 2022. Nos résultats montrent que la prédation des ravageurs est importante au début du printemps (mars-avril) tandis que la prédation intraguilde est importante vers la fin du printemps (mai-juin). De même, la prédation des détritivores diminue au cours du printemps. Ces dynamiques sont consistantes les deux années bien que les différentes espèces montrent des abondances relatives différentes entre les deux années. La consommation de plantes est caractérisée par la prépondérance du colza chez toutes espèces, ainsi que par la consommation d'adventices, mais avec des dynamiques contrastées les deux années, possiblement en rapport avec la contribution importante de N. salina.Pour étudier les dynamiques interannuelles, nous avons analysé le régime alimentaire de deux espèces de carabe dominantes dans le colza, Nebria salina et Poecilus cupreus, grâce à des échantillons capturés de 2013 à 2019 et conservés dans l'éthanol. Des échantillons fraîchement capturés ont été utilisés pour permettre une comparaison avec les anciens. Bien que les méthodes de capture et de conservation des anciens échantillons n'étaient pas optimales, nos résultats montrent qu'il est possible d'y avoir recours pour identifier des proies jusqu'à huit ans après la capture. En raison de la probable dégradation de l'ADN des carabes, davantage de données alimentaires sont obtenues des plus anciens échantillons par rapport aux plus récents. Nos résultats suggèrent aussi que le régime alimentaire des carabes varie significativement d'une année à l'autre et que la diversité du spectre de proies des carabes a diminué durant les huit années de l'étude. En plus de ces changements, nous montrons que plusieurs espèces de carabes ont connu des variations morphologiques au cours des 21 dernières années. L'évolution temporelle de la taille de plusieurs caractéristiques corporelles semble indiquer que les carabes font face à des pressions probablement liées à la nutrition et à la mobilité.Globalement, ces résultats démontrent de fortes dynamiques intra- et interannuelles du régime alimentaire des carabes et mettent en lumière leur rôle dans la régulation des ravageurs et des adventices. De futures recherches devront permettre d'identifier les paramètres environnementaux qui influent sur ces dynamiques.