Microsatellite Polymorphism and Genetic Structure of Florida Mottled Duck Populations

Abstract Little is understood concerning the effects regional isolation and habitat loss have had upon the genetic structure of Mottled Ducks (Anas fulvigula), a nonmigratory waterfowl species with a limited distribution. Our objective was to identify nuclear DNA-based markers for Mottled Ducks and determine levels of subdivision among populations in Florida. We screened 13 microsatellite primer pairs and identified six microsatellite loci that were variable in Mottled Ducks. These markers revealed a low level of genetic differentiation and a high level of genetic exchange among four Mottled Duck subpopulations within Florida. Over all populations, single-locus expected heterozygosities over the six loci surveyed ranged from 0.13–0.85. There were no significant differences in gene frequencies among the populations examined, and the Fst over 5 biparental loci was not different from zero. Our analysis of the Florida Mottled Duck population indicated high levels of heterozygosity and no evidence of genetic subdivision among breeding units. Polimorfismo en Microsatélites y Estructura Genética en Poblaciones de Anas fulvigula Resumen. Se tiene escaso conocimiento acerca de los efectos del aislamiento regional y de la pérdida de hábitat sobre la estructura genética de poblaciones de Anas fulvigula, un ave acuática no migratoria de distribución restringida. Nuestro objetivo fue identificar marcadores genéticos de ADN para A. fulvigula y determinar los niveles de subdivisión entre poblaciones en Florida. Examinamos 13 pares de iniciadores (i.e., primers) para microsatélites e identificamos seis loci que fueron variables en A. fulvigula. Estos marcadores revelaron un bajo nivel de diferenciación genética y un alto grado de intercambio genético entre cuatro subpoblaciones de A. fulvigula en Florida. Para todas las poblaciones, la heterocigocidad esperada en un locus varió entre 0.13–0.85 para los seis loci examinados. No hubo diferencias significativas en las frecuencias génicas entre las subpoblaciones examinadas, y el valor de Fst para los 5 loci biparentales no fue diferente de cero. Nuestros análisis de las poblaciones de A. fulvigula de Florida indicaron altos niveles de heterocigocidad y no mostraron evidencia de subdivisión genética entre las unidades reproductivas.