Epidemiology, typing and antibiotic resistant of Neisseria species in Lebanon by whole genome sequencing

Epidémiologie, typage et antibiorésistance de Neisseria spp. au Liban par séquençage de nouvelle génération des génomes Les Neisseria forment un genre de bactéries à Gram négatif en diplocoques appartenant à la classe des bêta-proteobacteria. Certains espèces sont des commensaux des épithéliums muqueux humains, tandis que deux espèces Neisseria meningitidis et Neisseria gonorrhoeae sont des pathogènes. L'identification de routine est basée sur des tests biochimiques, cependant plus récemment, de nouveaux outils avancés y compris le MALDI-TOF et la caractérisation génétique ont été utilisés pour identifier ce genre bactérien. Malheureusement, peu de données sont disponibles sur l’identification des espèces commensales de Neisseria et son corrélation avec l’infertilité.Pour ces raisons, il nous est apparu intéressant de monter un travail de thèse qui s’entoure autour de quatre axes principaux l’épidémiologie et la recherche clinique- la taxonomie du genre Neisseria- l’analyse et la comparaison génomique- la caractérisation moléculaire de la résistance aux céphalosporines chez Neisseria flavescens. En conclusion, l’ensemble de ces données obtenues montre que les Neisseria commensales ont un impact important sur la santé humaine. En plus, le genre Neisseria contient beaucoup des erreurs au niveau du génome et nécessite une reclassification qui réorganise la taxonomie de nouveau.