Caractérisation multiomique dans la compréhension des mécanismes contrôlant les traits floraux majeurs chez Rosa x damascena

La rose est communément appréciée en tant que plante ornementale et à parfum à travers le monde depuis l’antiquité́. Ainsi, les différents traits floraux comme la couleur des pétales, le parfum, la formation de fleur double et encore la floraison récurrente ont attirés l’attention des sélectionneurs pour créer plus de 35 000 variétés de roses modernes (Rosa x hybrida). Si la majorité des roses modernes sont cultivées pour la fleur coupée, les roses anciennes à parfum sont cultivées pour la production de l’huile essentielle de rose. Parmi ces roses à parfum appartenant majoritairement à la section Gallicanae du genre Rosa, l’espèce Rosa x damascena Mill. est la plus appréciée dans les secteurs cosmétique, pharmaceutique et l’industrie du parfum du fait de la grande diversité de métabolites secondaires produites dans la fleur. Alors que différentes des analyses chimiques de la fleur, de l’huile essentielle et de l’hydrolat de rose sont réalisées depuis ces deux dernières décennies, l’absence d’un génome de référence de haute qualité ainsi que de la recherche intégrée limite la compréhension des mécanismes moléculaires contrôlant la qualité de Rosa x damascena. Durant ma thèse, une étude multiomique a été réalisée sur Rosa x damascena, faisant appel aux données métabolomique, transcriptomique et génomique. À l’issue de cette étude, j’ai identifié des molécules volatiles et non-volatiles spécifiques à chacun des organes floraux et mis en évidence la corrélation entre la variation dans la production métabolique et l’expression différentielle des gènes de voies de biosynthèses de ces molécules. De plus, de nouvelles enzymes candidates impliquées dans le déterminisme de la spécificité métabolique chez Rosa x damascena sont proposées. En parallèle, la caractérisation de son génome a mis en évidence l’hétérogénéité structurelle reflétant l’origine hybride de cette rose tétraploïde. Enfin, ce travail a permis d’établir un atlas des données multiomiques qui permettra de répondre à d’autres questions biologiques chez Rosa x damascena, et vraisemblablement à d’autres rosiers.