Les troubles du spectre autistique au Liban : une étude épidémiologique et génétique

Les troubles du spectre autistique (TSA) sont des troubles neurodéveloppementaux complexes et multifactoriels impliquant des facteurs génétiques ainsi que des facteurs environnementaux. Il a été montré que des événements prénatals, périnatals et postnatals peuvent soit augmenter soit diminuer le risque des TSA. Les facteurs environnementaux sont susceptibles de moduler le risque des TSA lorsqu'ils sont associés avec des facteurs génétiques. En fait, des anomalies chromosomiques, des variations du nombre de copies (CNV) et des variants mononucléotidiques (SNV) ont été associés aux TSA. A ce jour, les facteurs environnementaux et génétiques ne sont pas encore complètement élucidés et la plupart des études sur les TSA sont menées sur les populations Américaines et Ouest-Européennes. Par conséquent, les objectifs de ma thèse s'articulent autour des deux axes suivants :1. Nous avons dans un premier temps cherché à identifier les facteurs de risque et de protection qui peuvent aider à la compréhension de la pathophysiologie des TSA et en fin à aboutir à l'atténuation des risques. Nos résultats ont montré que le stress pendant la grossesse, la présence de patients atteints de TSA et de patients atteints du trouble d'hyperactivité avec déficit de l'attention (TDAH) dans la famille étaient significativement associés aux TSA. D'autre part, un apport en multivitamines en particulier oméga 3 et vitamines B, un régime riche en céréales et une supplémentation en fer pendant la grossesse ont été identifiés comme des facteurs de protection contre les TSA.2. Dans un second temps, nous avons cherché à identifier des variations mononucléotidiques (SNV) et des petites insertions/délétions (indels) par le séquençage de l'exome entier (WES) chez cinq sujets qui n'avaient pas révélé de CNV liées aux TSA dans notre étude précédente. Cette étude a permis d'identifier un variant de novo dans le gène MIS18BP1 et deux autres variants hérités dans les gènes SLITRK4 et NHSL2. En outre, nos résultats ont confirmé la présence d'autres variations génétiques précédemment décrites et partagées entre les patients Libanais et d'autres populations atteintes de TSA. L'expression du gène MIS18BP1 a été analysée par PCR quantitative en temps réel (RT qPCR) dans le cortex de souris à différents stades de développement et les résultats ont montré qu'il est fortement exprimé au stade embryonnaire.Ces études ont permis d'établir des nouvelles hypothèses, de confirmer les données précédentes et de contribuer à la compréhension des TSA. Cependant, des investigations supplémentaires doivent encore être réalisées pour aboutir à une validation des facteurs de risque et des gènes candidats, afin de donner une compréhension cohérente de l'interaction entre les différents facteurs associés aux TSA.