Virus chikungunya et traitement antiviral

Les Alphavirus sont des virus à ARN enveloppés, d’un diamètre de 70 nm, à structure icosaédrique à symétrie de type T=4 (Choi et al. 1991; Cheng et al. 1995; Garoff et al. 2004). Ces virus, dont la répartition est mondiale, sont capables d’infecter une grande variétés d’animaux vertébrés (mammifères, oiseaux, poissons). Ces virus sont des arbovirus, c’est-à_dire des virus transmis par des arthropodes. Dans le cas des Alphavirus, la vectorisation est faite par des moustiques appartenant à plusieurs espèces. A ce jour, 29 espèces d’Alphavirus ont été identifiés, dont au moins 6 sont pathogènes pour l’Homme. Chez l’Homme, certains Alphavirus sont responsables d'encéphalites, d'arthrites, de fièvres, d'éruptions cutanées et peuvent être fatals (Thiruvengadam et al. 1965; Pialoux et al. 2006).Le premier Alphavirus isolé fut l'Encephalite Equine de l'Ouest (WEEV), en 1930 (Meyer et al. 1931). Les virus de l'encéphalite de l'Est (VEEV) et le virus de l'Encephalite Equine du Vénézuéla (VEEV) furent isolés respectivement en 1933 et 1938 (Gibbs EP. 1976 ; Beck et al. 1938 ; Kubes et al. 1939). Le Virus Sindbis isolé en Egypte en 1952 (Taylor et al. 1955), fut le premier Alphavirus responsables d’arthrites à être isolé. La mise en évidence de l'existence du CHIKV se fera 1952 en Tanzanie (Robinson 1955) (Lumsden 1955). Suivent alors les découvertes de l'ensemble des autres Alphavirus. Le South Elephent Seal virus (SESV), identifié en 2000 sur l'île australienne de Macquarie, est à l’heure actuelle le dernier Alphavirus découvert. La phylogénétique des souches de Chikungunya permet d’identifier des clades différents pour les souches d’Afrique de l’Est, de l’Ouest ou d’Asie, et l’analyse phylogénétique est très proche du O’Nyong-Nyong (Powers et al. 2000), Le séquençage de différents isolats de l’épidémie de 2005, a permis de mettre en évidence chez certains d’entre eux une mutation dans la glycoprotéine de l'enveloppe plus précisément dans E1, (Schuffenecker et al. 2006). Cette mutation entraine la substitution d'une arginine en position 226 au lieu de la valine (A226V), est un élément clé pour déterminer le choix d'un nouveau vecteur pour la transmission ou Aedes albopictus (qui le transmet sur l'île de La Réunion) par rapport au vecteur Aedes aegypti (Tsetsarkin et al. 2007). Cette mutation a ensuite été également trouvée en Inde en 2007. (Arankalle et al. 2007; Kumar et al. 2008; Santhosh et al. 2008).Le tableau clinique classique débute souvent par l’apparition brutale d’une forte fièvre (40°C) pendant 3 / 10 jours accompagnée de frissons intermittents (Deller et al.1967). La fièvre est, dans certains cas, bi-phasique, c’est-à-dire qu’elle diminue durant un ou deux jours, avant de remonter brutalement. Elle est généralement suivie d’érythèmes, de courbatures douloureuses ou myalgies et douleurs musculaires (Ozden et al. 2007) en particulier celles impliquant la douleur au niveau des extrémités (poignés, phalanges et chevilles) (Robinson 1955; Jadhav et al. 1965; Thiruvengadam et al. 1965). Egalement migraine, éruptions cutanées maculo-papuleuses parfois prurigineuses. L'éruption touchant le thorax et le visage les mains et les pieds, chez les enfants ont été observées des éruptions de type bulleux accompagné par un détachement cutané (Talarmin et al. 2007). L'évolution de la maladie régresse progressivement. Il n’y a aucun traitement antiviral efficace contre le CHIKV. Le traitement est donc essentiellement symptomatique et composé d'antalgiques non salicylés, de paracétamol et d'anti-inflammatoires non stéroïdiens. Ce travail se compose de deux parties : 1 partie sur l’étude phylogénétique du CHIKV et 1 partie sur l'étude des molécules antivirales. [...]