Dickeya-sukuiset bakteerit, uusi riesa perunanviljelyssä

Perunantyvi- ja märkämätä ovat perunalla esiintyviä bakteeritauteja, jotka mädättävät perunan varsientyviosia sekä perunan mukuloita pellolla ja varastossa. Näitä tauteja aiheuttavien bakteereiden esiintyminenon vakava laatuongelma varsinkin siemenperunan viljelyssä. Taudin esiintyminen heikentää luottamustakotimaisen siemenen laatuun, lisää paineita ulkomaisen siemenperunan tuontiin ja haittaa suomalaisensiemenperunan vientimahdollisuuksia. Lisäksi mukuloita pilaava märkämätä aiheuttaa vuosittain satojentuhansien kilojen varastohävikkejä etenkin ruokaperunateollisuudessa. Perunantyvi- ja märkämätääaiheuttavat bakteerit luettiin aiemmin Erwinia-sukuun, mutta niiden taksonomia on uudistettu hiljattain,minkä seurauksena ne jaetaan nykyään kahteen sukuun, Pectobacterium ja Dickeya.Pectobacterium-sukuisten bakteereiden on tiedetty jo kauan aiheuttavan tautia perunoilla Suomessa. Perunantautitilanteen on kuitenkin epäilty huonontuneen viime vuosina, minkä vuoksi perunoissa ja jokivesissäesiintyvät bakteerit kartoitettiin vuosina 2004-2007 toteutetussa tutkimuksessa. Tulokset osoittivat, että noin20% tyvimädästä johtui todennäköisesti Dickeya-sukuisista bakteereista (edelliseltä nimeltään Erwiniachrysanthemi). Näitä bakteereita on aiemmin pidetty kasvitautien aiheuttajana lämpimissä ja trooppisissamaissa. Ne ovat levinneet viime vuosina huolestuttavasti Keski-Euroopassa ja nyt niitä tavataan siis myösmeillä. Tutkimuksen tulokset osoittivat myös, että Suomesta löydetyt bakteerit voitiin jakaa kolmeenryhmään, joista kahta voitiin eristää sekä jokivesistä että perunoista ja yhtä löydettiin vain jokivesistä Etelä- jaLänsi-Suomesta. Osa sekä perunoista että jokivesistä eristetyistä kannoista oli hyvin virulentteja. Kaikkienvirulenteimmat kannat kuuluivat Dickeya dianthicola -lajiin, joka on karanteenitaudinaiheuttajakoristekasvien kasvihuoneviljelyssä. Monet eristetyt kannat aiheuttivat tyypillisiä tyvimätäoireita muttamyös nekroottisia oireita, jotka eivät muistuttaneet tyypillistä tyvimätää. Tämä saattaa aiheuttaa ongelmiakasvustotarkastuksissa, sillä uudet bakteerit saattavat jäädä niissä havaitsematta. Syyt Dickeya-sukuistentaudinaiheuttajien leviämiseen maahamme eivät ole selvät. Leviäminen saattaa olla seurausta ilmastonlämpenemisestä mutta myös lisääntyneestä maataloustuotteiden tuonnista tai bakteereiden sopeutumisestakylmempään ilmastoon.